Seizoen 1
Het begint met een gewoon meisje van de planeet Aarde genaamd Bloom. Ze leeft een heel normaal leven in de stad van Gardenia. Tot ze Stella ontmoet, de prinses van Solaria en fee van de zon. Ze zit in de problemen en Bloom helpt haar. Zo ontdekt zij haar eigen krachten. Stella overtuigt Bloom om samen naar Alfea, de beste feeënschool van alle rijken, te gaan. In Alfea vormt Bloom Winx Club. In de Winx zitten Booms 4 beste vriendinnen en kamer genoten Stella, Flora, Musa en Tecna. Later raken ze bevriend met de specialisten Sky, Brandon, Riven en Timmy.

Natuurlijk is er ook een vijand of vijanden. In dit geval zijn het de drie heksenzusjes Icy, Darcy en Stormy. Ook wel bekend als de Trix. De Trix zoeken de krachtigste bron van de hele magische dimensie, de kracht van de Drakenvlam. Dit is de kracht van Bloom. De Trix doen er alles aan om de Drakenvlam te pakken te krijgen en zo de sterkste worden van de hele dimensie. De Winx en de specialisten doen er alles aan om ervoor te zorgen dat dit niet gebeurd. Ondertussen komt Bloom grote geheimen te weten over haar planeet, ouders en kracht.

Seizoen 2

Na hun zomervakantie keren de Winx terug naar Alfea voor leerjaar 2. Dan ontmoeten ze een nieuwe fee genaamd Layla. Ze vraagt om hulp zodat ze haar Pixie vrienden kan redden van de gemene Lord Darkar. Lord Darkar wordt ook wel ‘Schaduw Feniks’ genoemd.

Hij wil heerser worden van de magische dimensie. Hiervoor moet hij de 4 stukken van de Codex vinden. Die zitten verstopt in Alfea, Wolkentoren, Red Fountain en in het Pixie dorp. Maar het Pixie Dorp is erg goed verstopt, dus heeft Darkar de Pixies ontvoerd en dwingt ze te vertellen waar het dorp ligt. Ondertussen is heel Magix bezig met het opbouwen van de stad na alle puinhoop die de Trix hebben veroorzaakt. Als de Winx naar Red Fountain gaan ontmoeten ze Helia,het neefje van Saladin en  een nieuwe specialist. Ook leren ze over een nieuwe transformatie, Charmix.

Seizoen 3 Winx Club: Enchantix

De Winx beginnen aan hun derde jaar op Alfea. Dit keer ontmoeten ze Valtor, de vijand van dit seizoen. Valtor is een gemene tovenaar die samen met de Trix de Winx wilt vernietigen en Magix wilt veroveren. Valtor is alleen te sterk voor ze, zelfs met hun nieuwe Charmix. Daarom moeten ze de nieuwe kracht zien te verdienen, Enchantix. Om de kracht te krijgen die Valtor wilt, moet hij elementen verzamelen van over de hele magische dimensie. Zo komen de Winx op ieders thuisplaneet en op nog veel meer bijzondere plekken. De Winx worden ook nog eens in de gaten gehouden door een mysterieuze man. Wie is deze persoon? Staat hij aan de kant van de Winx of aan die van valtor? Zal het de Winx lukken Valtor te verslaan met behulp van de Water Stars, Fairy Dust en nieuwe krachten?

Seizoen 4 Winx Club: The power of Believix

De Winx zijn terug! Nu zullen ze de kracht Believix moeten krijgen, een nieuwe transformatie om iemand te laten geloven in magie. Believix heeft 3 extra vleugels en 2 extra krachten om de Winx krachtiger te maken: Speedix, Zoomix, Tracix, Sophix en Lovix. Zij zullen ook moeten strijden tegen de Wizards van de Black Circle, een groep schurken die achter de laatste fee op aarde zit, zodat ze vol vermogen krijgen. De Winx moeten haar eerder vinden om haar te beschermen tegen de Wizards, maar ze moeten onopgemerkt blijven. Om te leven op Aarde, openen ze een dierenwinkel genaamd Love & Pet. Daar ontmoeten ze Roxy, een meisje die werkt bij de Frutti Music Bar. Al snel komen  ze erachter dat Roxy de laatste fee op aarde is. Roxy is steeds meer in staat om haar krachten te ontdekken. Door te geloven in zichzelf en in de Winx, zal ze veranderen in een fee en zal ze de Winx helpen de Wizards te verslaan en de gevangen feeën te redden. Maar de Wizards zijn niet hun enige probleem. Hoe moeten ze nu de elfjes van de aarde en hun koningin Morgana tegen houden? Zij zijn op zoek zijn naar wraak op de mens voor het niet geloven in ze, waardoor dit hen zwakker heeft gemaakt en ze zijn gevangengenomen door de Wizards. De Winx worden tot het uiterste getest in een strijd met de Wizards aangezien ze nu strijden om de mensheid te redden. Zullen de Winx slagen?

Seizoen 5 Winx Club: Beyond Believix

De Winx zijn terug. Dit keer zullen de Winx hun reis onder water meemaken en moeten ze het opnemen tegen  een nieuwe vreselijke schurk, Tritannus. Ooit was hij een normale triton die werd gemuteerd in een krachtige monster, veroorzaakt door vervuiling in de zee. Zijn belangrijkste doel is om over de hele wereld te regeren door het binnentreden van de Oneindige Oceaan!

De Believix macht is niet sterk genoeg onder water en als de Believix vleugels nat zijn, zijn ze nutteloos. Om Tritannus te verslaan zullen de Winx een nieuwe kracht genaamd Sirenix moeten verdienen. Maar om ondertussen toch nog wat sterke krachten te hebben, krijgen ze de kracht Harmonix. De Winx hebben maar een bepaalde tijd om de Sirenix kracht te krijgen. Lukt het ze niet, dan verliezen ze hun krachten voor altijd.

De Winx krijgen hulp van prachtige zeedieren zoals de Selkies. Zullen de Winx slagen in het redden van de Magische Dimensie? Lukt het ze te voorkomen dat Tritannus de kwade keizer van de Oneindige Oceaan wordt? En zullen de Winx op tijd zijn met de Sirenix opdrachten?

Seizoen 6

Een nieuwe heks genaamd Selina komt deelnemen aan de Wolkentoren. Zij heeft een duivels boek vol met sprookjes en legendes die ze kan laten uitkomen door het verhaal voor te lezen. Dit boek heet het Legendarium. De Trix willen dit boek graag hebben en sluiten Selina aan bij de Trix. Ze nemen wolkentoren over en laten het vliegen zodat ze snel bij alle scholen van de magische dimensie komen.

Bloom leid de Winx tegen de Trix en Selina, maar plotseling verliezen alle Winx behalve Bloom hun krachten. Zal het de Winx lukken om hun krachten op tijd terug te krijgen, alle scholen van de magische dimensie te redden en het Legendarium voorgoed te sluiten? Dit nieuwe seizoen zit vol met nieuwe avonturen, komedie, actie, oude vriendschappen en natuurlijk liefde.